工程学院的前身是始建于1980年的海洋工程系，经过三年筹建，从1983年开始招收第一届学生，1993年成立工程学院，目前已发展成为一所以海洋为特色的工科学院。学院现设有海洋工程系、土木工程系、机电工程系、自动化及测控系四个系，港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程、土木工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、工业设计、自动化七个专业，海洋工程山东省重点实验室、海洋机电设备与仪器重点实验室、海岸与近海工程研究所、城市与工程管理信息化实验室等教学科研机构，建设工程检测鉴定中心、节能技术中心、行远海洋工程设计院、荣成专家工作站等社会服务机构。
拥有港口、海岸及近海工程国家重点学科，水利工程博士后流动站，港口、海岸及近海工程山东省重点学科，港口、海岸及近海工程博士点，港口、海岸及近海工程、水文学及水资源、水力学及河流动力学、海洋能利用技术、结构工程、防灾减灾工程及防护工程、桥梁与隧道工程、管理科学与工程、机械电子工程、机械制造及其自动化、机械设计及理论、海洋机电装备与仪器、工程热物理、控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、模式识别与智能系统学术型硕士学位点，水利工程、建筑与土木工程、项目管理、机械工程、动力工程、控制工程专业硕士学位点。
