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武汉大学水生态研究所于2017年12月在水利水电学院成立,宗旨是通过对生态系统结构化过程的深度解析,寻找缓解人类活动引起的生态与环境问题的有效途径,发挥长江流域工程-自然复合生态系统对经济社会可持续发展的支撑作用;具体任务包含水生态与水环境领域的基础理论研究、应用技术开发、高端人才培养和国际合作平台构建。